天然来源化合物干预Ubc12酶活的筛选体系构建及其发现研究开题报告

 2022-12-28 10:19:16

1. 研究目的与意义

(一)研究内容

本实验将通过构建科学的反应体系,从已知天然化合物库中筛选出能够影响E2酶Ubc12酶活的化合物,希望能通过筛选出的天然来源化合物干预Ubc12调控的Neddylation过程,进而影响Neddylation的生物学功能。具体研究内容如下:

1、纯化实验所用蛋白,设计并构建科学的筛选体系;

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2. 文献综述

Ubc12的生物学功能及在肿瘤治疗中的研究进展

摘要:类泛素化修饰Neddylation是与泛素化修饰机制相似的蛋白质翻译后修饰方式之一,类泛素蛋白NEDD8经E1酶活化后,结合到E2酶上,最终连接到E3酶上与E3酶一起识别靶蛋白并对其进行类泛素化修饰。类泛素蛋白连接酶12(Ubc12)是目前已知的关键的NEDD8的E2酶之一,可以特异性介导NEDD8发生Neddylation修饰,而NEDD8被报道在多种肿瘤中过表达,因此以Ubc12为靶点进行干预可能成为治疗肿瘤肿瘤的有效策略。本文对Ubc12的生物学功能及在肿瘤治疗中的研究现状展开综述。

关键词:Ubc12,Neddylation,肿瘤

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3. 设计方案和技术路线

研究方案

1、实验方法

1.1纯化蛋白:(1)根据所选蛋白的CDS序列及所需载体的酶切位点设计引物和酶切位点,对已有的少量蛋白进行PCR扩增;(2)通过琼脂糖凝胶分离出扩增的目标DNA分子,用胶回试剂盒进行回收;(3)通过酶切体系酶切所选载体,设置对照组用琼脂糖凝胶验证酶切结果,并对酶切正确的载体进行回收;(4)将目标DNA分子和酶切后的载体进行连接,得到完整质粒后转化、摇菌、小抽验证再送测序,验证质粒构建是否正确。(5)将构好的质粒转化到菌株中,37C摇菌,挑单克隆后再摇菌,然后以1:100的比例接种到大体系;配制LB,灭菌后加入抗生素和上述菌液,摇菌,测OD值达0.6后加入预先摸索出的最佳浓度的IPDG诱导剂诱导;诱导完成后高压破菌,最后使用AKTA pure 25仪器纯化蛋白。(6)大规模纯蛋白之间先通过预实验选择合适的菌株以及IPDG温度、浓度等诱导条件。待选菌株为BL21、DE3;IPDG诱导浓度设置为100μlmol/L、200μlmol/L、400μlmol/L、1000μlmol/L,及未诱导组别,从中筛选最佳浓度;IPDG诱导温度一般从37C及25C中筛选。

1.2 Western blot样本蛋白定量后,加loading分装,95C煮5min,用SDS-PAGE 凝胶分离后转到 PVDF 膜上。根据蛋白条带位置剪膜,用 5% 脱脂牛奶室温下封闭1 h,用TPBS洗膜,4 ℃ 条件下孵育一抗过夜,洗膜,15min洗一次,5min洗两次,室温下孵育对应二抗 1h,再次洗膜,15min洗一次,5min洗两次,在暗室内用ECL曝光液曝光。

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4. 工作计划

1、完成文献检索与综述撰写,初步拟定实验方案,准备好实验试剂及耗材。

2、已初步纯化实验过程中所用到的蛋白Ubc12及UBA3。

5. 难点与创新点

1、创新性的用天然来源化合物来干预Ubc12的酶活,进而影响Neddylation的修饰过程及其生物学功能;

2、创新性的从构建筛选体系的角度研究能够干预Ubc12酶活的天然来源化合物;
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