1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)
本研究旨在探讨G蛋白偶联受体40 (Gprotein-coupled recept 40,GPR40)和G蛋白偶联受体41 (G protein-coupled recept 41,GPR41) 基因在物种间的同源性以及在猪不同部位的表达情况和程度。
G蛋白偶联受体又称为螺旋跨膜蛋白受体,是一大类存在于细胞表面,通过蛋白介导其生物效应的一类膜受体的总称,是一类重要的信号分子受体。它可以通过与GTP结合蛋白偶联结合细胞外多种配体从而可以参与调控许多生理功能。G蛋白偶联受体是目前已知的体内最大的蛋白质受体超家族[1]。
2. 研究的基本内容和问题
研究的目标:比对发现各物种之间基因的相似性和同源性,进而探讨GPR40和GPR41基因在各物种之间亲缘关系的远近。研究猪的GPR40和GPR41基因在其在不同的组织中的分布情况,为研究GPR40和GPR41基因的功能奠定基础。
研究的内容:本实验通过NCBI下载己有的各物种的GPR40和GPR41基因序列用MGEA软件,核对GPR40和GPR41在不同种动物上的核苷酸差异,制作进化树和遗传距离表,比对发现各种动物之间基因的相似性和同源性,进而探讨该基因在各个物种间亲缘关系的远近。通过相对定量实时荧光PCR(Relative quantitative real-time PCR)法本对猪各组织的GPR40和GPR41基因进行扩增,来研究猪的GPR40和GPR41基因在各个组织中的表达情况和程度。
拟解决的关键问题:合理选择一些有意义,有代表性物种的GPR40和GPR41基因制作出进化树和遗传距离表,比对发现各种畜禽之间基因的相似性和同源性。根据实际情况选取猪的某些部位进行采样检测后,通过GPR40和GPR41基因的分布情况和表达程度揭示其在不同的组织中发挥的生理功能。
3. 研究的方法与方案
1GPR40和GPR41在不同畜禽品种间的序列比较
将各种动物的GPR40和GPR41基因序列,利用MEGA软件制作出进化树和遗传距离表,分析同源性。
2 GPR40和GPR41在猪不同部位的分布
4. 研究创新点
迄今,关于GPR40的研究主要集中在GPR40在相关疾病中调控功能的研究和GPR40激动剂和拮抗剂的研究上,关于GPR41的研究主要集中在人、大鼠、小鼠、羊、牛和兔基因的遗传多态性与生长性状关联性研究上,目前关于GPR40和GPR41的生物信息学分析较少,本实验可以通过制作进化树和遗传距离表,比对发现各种动物之间基因的相似性和同源性,进而探讨该基因在畜禽间亲缘关系的远近。 因为GPR40和GPR41基因可在猪的多种组织中表达,且其在不同组织中的表达具有组织特异性,所以本实验通过了解GPR40和GPR41在不同的组织的表达情况和程度,有助于揭示GPR40和GPR41在不同的组织中发挥重要的生理功能。
5. 研究计划与进展
(1)2020年3月至4月中旬:对实验涉及的相关理论知识的查阅与收集。 (2)2020年4月中旬至5月中旬:进行实验的前期准备工作,学习实验操作方法。学习MEGA软件的使用。通过NCBI,将己有的各种动物的GPR40和GPR41基因序列用MEGA并制作进化树和遗传距离表。 (3)2020年5月:通过相对定量实时荧光PCR法本对猪各组织的GPR40和GPR41基因进行扩增,来研究其在各组织中的表达情况和程度。分析和总结实验结果,准备结题工作,根据实验研究结果撰写毕业论文。 |
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