1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)
课题意义:
犬冠状病毒病是由犬冠状病毒(Canine Coronavirus, CCoV)引起的以厌食、嗜睡、呕吐和腹泻为主要特征的一种传染病,在小动物临床上较为常见[1]。作为导致犬腹泻的主要病原体,犬冠状病毒病表现为高发病率,低死亡率的特征,但其对幼犬的危害较为显著。发病严重的幼犬会因器官衰竭或严重脱水而转归死亡[2]。该病毒首次于1971年在德国被发现,随后便在全球各地得到了广泛的报道,成为一种全球流行病[3]。由此可见,犬冠状病毒病不仅在国内外的小动物临床上得到较多的关注,而且对犬具有一定的危害性。综上所述,本课题致力于阐明犬冠状病毒在全国各地的分布情况,并结合病史、年龄、性别、季节等因素综合分析,为临床上犬冠状病毒的诊断和防治提供理论依据和参考。
国内外研究进展:
2. 研究的基本内容和问题
目标:从各地宠物医院采集1000份犬鼻腔分泌物和粪便样品进行犬冠状病毒检测,对犬冠状病毒阳性样品额外进行S基因测序,与NCBI上的参考株进行比对,使用软件分析序列差异及建立系统发育进化树,阐述犬冠状病毒在全国范围内的流行情况以及与参考株之间的变异情况。
内容:从全国各地的宠物医院中采集1000份左右的犬鼻腔分泌物和粪便样品,对其中的犬冠状病毒进行检测,统计其阳性率。此外,使用病毒RNA提取试剂盒提取目的核酸,进行S基因扩增并送公司测序,再与NCBI上的各参考株进行序列对比,统计其核苷酸及氨基酸的相似度,并构建系统进化树,阐述本研究的犬冠状病毒与已报道的犬冠状病毒及人冠状病毒的变异程度与进化关系。
拟解决的关键问题:
3. 研究的方法与方案
研究方法:本研究主要通过采集临床上健康以及有呼吸道、消化道症状的犬鼻腔分泌物和粪便样品,进行样品处理和冠状病毒检测,并结合发病动物病史、品种、年龄、季节和性别等因素,加以病毒S基因相似度和进化树分析,全面阐述犬冠状病毒的变异程度以及和参考株的遗传进化关系。
技术路线:本研究主要通过PCR和测序等技术手段来开展课题。
实验方案:
4. 研究创新点
特色:犬作为人类主要的伴侣动物,与人有着密切的接触。犬中也可分离出冠状病毒,但目前犬中冠状病毒的分布以及与人冠状病毒之间的遗传关系尚不清楚。本项目据此选题,阐明犬中冠状病毒的分布情况,以及与人冠状病毒之间的进化关系,对正确认识犬冠状病毒致病机理,以及对犬冠状病毒病的诊断和防控都具有重要的参考价值。
创新之处:
(1)获取犬冠状病毒最新的流行情况,为临床防控提供理论参考
5. 研究计划与进展
项目时间计划:
(1)2020年2月—2020年4月:从宠物医院完成样品的采集和检测工作。
(2)2020年4月—2020年5月:整理数据资料进行分析,撰写毕业论文。
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