江苏省鳜鱼群体遗传多样性分析及微卫星亲子鉴定开题报告

 2023-02-16 09:19:37

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

1.本课题的意义鳜鱼(Siniperca chuatsi)俗称桂花鱼,隶属鲈形目(Perciformes)、鳜亚科(Sinipercinae),是中国优质的淡水养殖鱼类,也是特有的肉食性鱼类[1-2]。

本次实验选择的是江苏省内五湖一江水域中的野生鳜鱼群体。

随着中国鳜鱼养殖业的迅速发展,由养殖群体的近亲交配和遗传漂变所导致的种质退化越来越明显,养殖病害的暴发日趋严重;而且由于一些鳜鱼养殖品种生长缓慢,也严重制约了鳜鱼养殖产业化的发展。

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2. 研究的基本内容和问题

1.研究的目标:以江苏省五湖一江的鳜鱼群体为研究对象手机种质资源数据进行遗传多样性分析,利用微卫星分子标记技术对他们进行亲子鉴定,确认鳜鱼群体亲本系谱信息。

2.研究的内容:根据微卫星引物的扩增结果和微卫星位点在家系中的遗传参数信息来进行遗传多样性分析以及亲权分析。

3.拟解决的关键问题:(1)收集江苏省五湖一江鳜鱼群体种质资源数据,进行研究;(2)获得微卫星分子标记进行亲子鉴定的技术

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3. 研究的方法与方案

1.研究方法:提取实验鱼基因组DNA,设计微卫星引物,然后构建PCR反应体系来进行扩增及效果检测,用Cervus3.0软件对电泳的数据结果进行分析处理,并统计微卫星位点的等位基因数(Na)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)和多态信息含量(PIC)等。

2.实验方案及技术路线:取亲本鳍条样品和子代全鱼样品提取基因组DNA,设计微卫星引物,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳从中筛选出多态性好的引物,进行PCR扩增。

扩增产物用琼脂糖凝胶电泳检验扩增效果,再用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离。

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4. 研究创新点

首次以江苏省五湖一江鳜鱼群体为研究对象,利用微卫星分子标记技术进行亲子鉴定;拟选用多态性较丰富的微卫星标记,使亲子鉴定率与已有实验相比为较高;拟选用20个左右微卫星标记,既可以满足数量多也可以满足多态性高的要求,计划使最后的得到的非亲排除率和鉴定率也较高。

5. 研究计划与进展

1.2017年5月-2017年7月:课题的选定与实验准备阶段(1)查阅大量文献并综合分析鳜鱼遗传分析及亲子鉴定的研究进展,最终确定课题(2)所需实验试剂、器材的购置与准备(3)实验方案的初步设定2.2017年7月-2018年3月:实验的正式开展阶段(1)收集野生亲本(2)基因组DNA的提取(3)微卫星引物的设计与筛选(4)PCR扩增及检测(5)统计分析3.2018年3月-2018年4月:数据收集与整理(1)微卫星引物的扩增结果分析(2)遗传多样性分析(3)选取家系进行亲子鉴定(4)微卫星位点排除概率(5)家系鉴定4.2018年4月:论文初稿的攥写5.2018年5月:论文修改、定稿及论文答辩

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