茅苍术FPPS基因的克隆及生物信息学分析开题报告

 2023-01-06 16:11:14

1. 研究目的与意义

茅苍术Atractylodes lancea(Thunb.) DC. 是菊科苍术属茅苍术的干燥根茎, 近年来,野生茅苍术资源愈见匮乏,然而其种植产量不尽如人意。

萜类是自然界最为丰广的次级代谢产物,且与药用植物的生物学和药理学性质密切相关。

茅苍术挥发油中倍半萜类组分的含量较高,而植物体内主要以MVA途径合成倍半萜,法呢基焦磷酸合酶(farnesyl diphosphate synthase,下简称FPPS)是目前研究较多的相关酶之一。

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2. 文献综述

见附件

3. 设计方案和技术路线

一.研究方案:1.材料采集于江苏句容茅山采集菊科植物茅苍术A. lancea(Thunb.) DC.。

2.FPPS保守区克隆(1)根椐 GenBank 提供的 FPPS 同源基因序列, 设计简并引物。

(2)以反转录后的 cDNA为模板进行保守区片段的 PCR 扩增(3)FPPS基因的3端和5端利用RACE技术扩增。

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4. 工作计划

2022.1.7-2022.2.28 查阅相关文献资料。

2022.3.1-2022.3.31 学习仪器的结构与相关操作。

2022.4.1-2022.4.15 选择实验材料、试剂、设备。

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5. 难点与创新点

首次利用cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术来对茅苍术FPPS进行全长扩增。

通过植物相关氨基酸序列的系统进化分析, 有助于了解植物进化轨迹, 对进一步认识植物基因功能有着十分重要的意义。

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