齐墩果酸抗肿瘤靶点的初步探索开题报告

 2022-12-08 10:03:53

1. 研究目的与意义

齐墩果酸是从龙胆科植物獐牙菜属的青叶胆全草或女贞子的果实中分离提取得到的一种五环三萜类化合物,为广谱抗菌药。齐墩果酸广泛地存在于食物、医学草本植物等植物中。1908年,英国的Powers首次从木樨科植物的叶中分离出了齐墩果酸,Ruzicka在1946年确定了齐墩果酸的结构。1955年,在日本女贞果实中发现含有齐墩果酸。1975年,我国湖南医药工业研究所进行了青叶胆抗肝炎有效成分的化学和药理研究,鉴定其中一单体为齐墩果酸。目前据不完全统计,有126种植物含有齐墩果酸。齐墩果酸是我国首次从植物中发现的、治疗急性黄疸型肝炎和慢性病毒性肝炎比较理想的药物之一。

齐墩果酸作为抗肝炎药物已上市多年,并取得一致好评。齐墩果酸是植物化学成分,毒性很低,具有多种生物活性。迄今为止,已发现了齐墩果酸具有诸多的功能药理作用,如保肝护肾作用、解肝毒作用、降糖作用、降血脂作用、消炎作用、免疫双向调解作用、抗血小板凝集作用、抗突变、抗癌作用、抗艾滋病毒等。因此,齐墩果酸已得到越来越广泛的使用,如随着畜牧业的发展和社会的进步,抗生素作为饲料添加剂的安全性引起了广泛争议,而齐墩果酸可提高畜禽免疫力、抗应激能力、抗氧化功能,其饲用价值越来越受到人们重视,并被作为抗生素替代品,研究其在饲料、畜牧生产中的应用价值;以齐墩果酸为原料开发的药物齐墩果酸片已经应用于临床作为肝病辅助药,用于治疗传染性急性黄疸型肝炎及肝硬化,具有明显的降低谷丙转氨酶的作用;齐墩果酸作为抗肝炎药,用于治疗病毒性迁延性慢性肝炎,对症状、体征和肝功能均有明显改善作用。此外,齐墩果酸作为恶性肿瘤的免疫治疗用药已经进入二期临床,作为天然化合物齐墩果酸具有抗癌、抗菌、抗病毒等药理活性并且有毒副作用小的优点,是一种很具有开发潜力的天然产物,可以作为药物或保健品的原料。根据齐墩果酸的促免疫作用,在抗HIV方面的研究也已开展起来,齐墩果酸对AIDS的防治也有一定作用。齐墩果酸对恶性肿瘤化疗造成的免疫功能下降的恢复和对抗结核药物的肝损害的保护意义重大,恶性肿瘤是对人类生命威胁最严重的疾病。这说明研究齐墩果酸对恶性肿瘤的治疗有非常广阔的开发前景,相信今后深入研究开发会有更丰硕的成果问世。本课题将通过基于受体三维结构的分子对接技术,探索齐墩果酸与肿瘤细胞凋亡相关蛋白的结合情况。

分子对接技术的主要思路是针对某一个或多个与目标疾病相关的靶标蛋白,对药物化学成分和天然产物数据库进行虚拟筛选,根据对接后的得分结果,寻找与靶标蛋白具有特异作用的候选化合物,然后进行生物活性检测,最终筛选出具有活性的先导化合物。分子对接技术提高了化学活性评价的效率和先导化合物发现的导向性,为进一步挖掘新药物资源提供了新方法。分子对接技术的主要优点是:首先,小分子配体基本上来自现有化合物数据库或制药公司自己的法人数据库,合成路线比较成熟,而且其中很大一部分可以向供应商定购,目前已开发出的中药有效成分三维结构数据库有中药化学数据库(TCMD)和中国天然产物数据库(CNPD)。这2个数据库成为虚拟筛选活性化合物的重要工具,被应用于先导化合物的设计,并且取得了不少成功实例。因此,分子对接技术可以大大加快先导化合物的发现进程。其次,分子对接是从整体上考虑配体与受体结合的效果,能比较好的避免其他方法中容易出现的局部作用较好,而整体结合欠佳的情况。很多研究将分子对接技术应用于中药复方作用机制的研究,并成功用于阐释黄连解毒汤、血必净、复方心可舒、血府逐瘀汤、清热消癥饮的效应物质基础和多导靶向作用。因此,将齐墩果酸与抗肿瘤靶点进行分子对接,从分子水平阐释齐墩果酸与靶点的作用机制,有利于解析齐墩果酸对恶性肿瘤治疗作用的机理。

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2. 研究内容与预期目标

(1)查阅并综述齐墩果酸的研究进展以及分子对接技术在天然产物领域的应用情况,设计出与齐墩果酸作用机理相关的受体-配体结合研究方案;

(2)通过autodock、pymol等软件计算齐墩果酸三维结构与特定蛋白受体之间的对接情况及结合能,确定齐墩果酸的作用靶点及氨基酸残基;

(3)在课题研究过程中学会综述文献、熟练使用autodock对受体-配体结合进行模拟计算、锻炼独立思考问题能力。

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3. 研究方法与步骤

研究方法:采用分子对接技术对齐墩果酸抗肿瘤靶点进行研究。

研究步骤:

1. 应用Chemdraw软件画出齐墩果酸分子结构,在蛋白质PDB晶体结构数据库(http://www.pdb.org)中找寻蛋白受体的结构;

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4. 参考文献

[1] 刘亭亭,王萌.女贞子化学成分与药理作用研究进展[J].中国实验方剂学杂志,2014,20(14):228-234.

[2] 罗小民. 分子对接在药物设计中的应用. 博士学位论文. 中国科学院上海药物研究所

[3] 胡翠英, 郭伟强, 藏帅, 顾华杰, 蒋伟娜, 王桃云. 利用Autodock预测苍术酮的潜在抗肿瘤靶点[J]. 生物技术, 2014, 24(6): 60-63.

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5. 工作计划

(1)2022-12-25~2022-3-18(第1-2周)查阅文献、设计方案、完成开题报告。

(2)2022-3-19~2022-6-10(第3-14周)完成分子对接工作,总结研究结果。

(3)2022-6-11~2022-6-22(第15-16周)撰写毕业论文并答辩。

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