1. 研究目的与意义
当前抗病毒药主要为神经氨酸酶抑制药(奥司他韦和扎那米韦)和M2离子通道阻滞药(金刚烷胺和金刚乙胺)两类。但金刚烷胺副作用大,现已较少使用;金刚乙胺仅对甲型流感病毒有效,奥司他韦不适合抢救重症患者,扎那米韦吸入给药,需在指导下学习使用,还对哮喘和慢性阻塞性肺疾病患者有危险。并且流感病毒耐药株不断出现,因此,迫切需要研发新的广谱抗病毒药物应用临床。
法匹拉韦(favipiravir,商品名Avigan)由日本富山化工制药公司开发,作为一种新型广谱抗RNA病毒药物,能够选择性抑制病毒复制相关的RNA聚合酶。2014年3月在日本批准上市,用于甲型、乙型流感的抗病毒治疗。2020年2月15日,浙江省海正药业有限公司研制的“法维拉韦片”(法匹拉韦)获得国家药监局批准上市,适应症为用于成人新型或复发流感的治疗。除流感病毒外,该药还对多种RNA病毒展现出良好的抗病毒作用,如埃博拉病毒、沙粒病毒、布尼亚病毒、狂犬病毒等。
2. 研究内容与预期目标
本课题研究内容是要求学生在查阅抗病毒药物法匹拉韦相关文献报道的基础上,通过计算机模拟技术,对法匹拉韦与2019-nCoV靶点蛋白的相互作用进行研究。具体研究内容包括:
(1)查阅并综述抗病毒药物法匹拉韦在各疾病领域的研究进展及作用机制,尤其2019年底以来法匹拉韦在新型冠状病毒肺炎临床的应用情况;
(2)熟悉计算机模拟技术在药物研发领域的应用情况,综述基于受体三维结构的分子对接技术(molecular docking)在研究药物作用机理方面的进展,并设计出与法匹拉韦抗2019-nCoV机理相关的受体-配体结合研究方案;
3. 研究方法与步骤
研究方法:采用分子对接技术(molecular docking)对2019-nCoV靶点进行研究。
研究步骤:
1. 应用Chemdraw软件画出法匹拉韦分子结构,在蛋白质PDB晶体结构数据库(http://www.pdb.org)中找寻蛋白受体的结构;
4. 参考文献
[1] Snijder EJ, van der Meer Y, Zevenhoven-Dobbe J. Ultrastructure and Origin of Membrane Vesicles Associated with the Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus Replication Complex. J Virol, 2006, 80(12): 5927-5940.
[2] Clercq ED. Anti-HIV drugs: 25 compounds approved within 25 years after the discovery of HIV. Int J Antimicrob Agents, 2009, 33(4): 307-320.
[3] Xu X, Chen P, Wang J, et al. Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission. Sci China Life Sci, 2020, 63(3): 457-460.
5. 工作计划
(1)2022-12-23~2022-3-15(第1-3周)在查阅文献资料的基础上,写出开题报告。
(2)2022-3-16~2022-5-31(第4-14周)完成抗病毒药物法匹拉韦与2022-nCoV靶点蛋白(7个)的分子对接研究并推测其结合位点及氨基酸残基等。
(3)2022-6-1~2022-6-12(第15-16周)撰写毕业论文并答辩。
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